每赛季参加亚冠比赛的4支球队小组赛轮空，直接晋级八强，其余14支球队被分成两个小组，进行单循环比赛。最后按积分排名，每小组前两名出线。若积分相同，则依次以净胜球，进球数，胜负关系排名决定。八强赛与半决赛采取两回合主客场淘汰制，如总进球数相同，则计算客场进球，若还未分出胜负则进行加时，倘若加时也未分胜负则进行点球大战。决赛在中立场进行，90分钟内未分胜负，则直接进行点球决胜。

年份	冠军球队	决赛比分	亚军球队	季军	第四名
1992	川崎绿茵	1-0	清水心跳	鹿岛鹿角	名古屋鲸八
1993	川崎绿茵	2-1	清水心跳	横滨水手	大阪钢巴
1994	川崎绿茵	2-0	磐田喜悦	横滨水手	大阪钢巴
1995	未举行	-	-	-	-
1996	清水心跳	3-3 (点球5-4)	川崎绿茵	柏太阳神	平冢比马
1997	鹿岛鹿角	7-2 (首回合2-1、次回合5-1)	磐田喜悦	横滨水手	名古屋鲸八
1998	磐田喜悦	4-0	市原JEF联	鹿岛鹿角	清水心跳
1999	柏太阳神	2-2 (点球5-4)	鹿岛鹿角	FC东京	名古屋鲸八
2000	鹿岛鹿角	2-0	川崎前锋	名古屋鲸八	京都紫不死鸟
2001	横滨F•水手	0-0 (点球3-1)	磐田喜悦	鹿岛鹿角	名古屋鲸八
2002	鹿岛鹿角	1-0	浦和红钻	清水心跳	大阪钢巴
2003	浦和红钻	4-0	鹿岛鹿角	清水心跳	磐田喜悦
2004	FC东京	0-0 (点球4-2)	浦和红钻	东京绿茵1969	名古屋鲸八
2005	市原JEF联	0-0 (点球5-4)	大阪钢巴	浦和红钻	横滨F•水手
2006	千叶市原JEF联	2-0	鹿岛鹿角	川崎前锋	横滨F•水手
2007	大阪钢巴	1-0	川崎前锋	鹿岛鹿角	横滨F•水手
2008	大分三神	2-0	清水心跳	名古屋鲸	大阪钢巴
2009	FC东京	2-0	川崎前锋	横滨F•水手	清水心跳
2010	磐田喜悦	5-3 (加时)	广岛三箭	川崎前锋	清水心跳
2011	鹿岛鹿角	1-0 (加时)	浦和红钻	名古屋鲸	大阪钢巴
2012	鹿岛鹿角	2-1 (加时)	清水心跳	柏太阳神	FC东京
2013	柏太阳神	1-0	浦和红钻	横滨F•水手	川崎前锋
2014	大阪钢巴	3-2	广岛三箭	柏太阳神	川崎前锋
2015	鹿岛鹿角	3-0	大阪钢巴	神户胜利船	新潟天鹅
2016	浦和红钻	1-1 (点球5-4)	大阪钢巴	FC东京	横滨F•水手
2017	大阪樱花	2-0	川崎前锋	大阪钢巴	仙台七夕
2018	湘南海洋	1-0	横滨F•水手	柏太阳神	鹿岛鹿角
2019	川崎前锋	3-3 (点球5-4)	札幌冈萨多	大阪钢巴	鹿岛鹿角
2020	FC东京	2-1	柏太阳神	川崎前锋	横滨F•水手
2021	名古屋鲸	2-0	大阪樱花	浦和红钻	FC东京
2022	广岛三箭	2-1	大阪樱花	浦和红钻	福冈黄蜂
2023	福冈黄蜂	2-1	浦和红钻	横滨水手	名古屋鲸